Neuromapas: interpretación estructural y funcional de mapas cerebrales
Las tecnologías de imágenes se utilizan cada vez más para generar mapas de referencia de alta resolución de la estructura y función del cerebro. La comparación de mapas generados experimentalmente con otros mapas facilita el descubrimiento científico interdisciplinario.
Aunque las iniciativas recientes de intercambio de datos aumentan la accesibilidad de los mapas cerebrales, los datos a menudo se comparten en sistemas de coordenadas dispares, lo que impide comparaciones sistemáticas y precisas.
Markello et al. presentaron neuromaps, una caja de herramientas para acceder, transformar y analizar anotaciones cerebrales, tanto estructurales y funcionales.
Los autores implementaron funcionalidades para generar transformaciones de alta calidad entre cuatro sistemas de coordenadas estándar.
La caja de herramientas incluye mapas de referencia seleccionados y ontologías biológicas del cerebro humano, como ontologías moleculares, microestructurales, electrofisiológicas, de desarrollo y funcionales.
Se habilita una sólida evaluación cuantitativa de la similitud de mapa a mapa a través de un conjunto de modelos nulos que preservan la autocorrelación espacial.
Neuromaps combina datos de acceso abierto con una funcionalidad transparente para estandarizar y comparar mapas cerebrales, lo que proporciona un flujo de trabajo sistemático para un análisis completo de enriquecimiento de anotaciones estructurales y funcionales del cerebro humano.
La caja de herramientas del software neuromaps está disponible en https://github.com/netneurolab/neuromaps
REFERENCIA: Markello, RD, Hansen, JY, Liu, ZQ. et al. Neuromapas: interpretación estructural y funcional de mapas cerebrales. Nature Methods (2022).